Une des valeurs naturelles que la municipalité de Óbidos vante est la lagune de Obidos, ceci est le système de lagune côtière à une plus grande mesure, au Portugal, un système s’étend en amont pour deux canaux, à l’ouest par le bras Bom Sucesso et cela par Barrosa bras. Cette lagune est la frontière terrestre au nord avec le comté de Caldas da Rainha, en particulier dans les paroisses de Foz do Arelho et Nadadouro, et au sud avec la commune de Obidos, dans les paroisses de Vau et Santa Maria. En ce qui concerne la faune trouvés dans la lagune de Obidos, se compose d’espèces de poissons telles que le bar, la sole, la plie, le turbot, d’or, la daurade, le rouget, même des espèces telles que les palourdes, les coques, les moules, les crevettes, poulpes, l’anguille, le crabe vert, entre autres. En ce qui concerne la communauté de l’avifaune, ceci est un rôle écologique important dans l’écosystème, les espèces identifiées comme le héron, le canard colvert, huîtriers, long, jambe courlis, sternes, hérons Boieira, aigrette neigeuse, gaivinha bec noir.